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为规范医疗和基础医疗机构会计核算，保证会计信息的真实、完整、根据《中华人民共和国会计法》、事业单位会计准则及国家有关法律法规的规定，财政部、卫生部制订并颁布《医院会计制度》、《基层医疗卫生机构会计制度》。《医院会计制度》适用于中华人共和国境内各级各类独立核算的公立医院，包括综合医院、中医院、专科医院、门诊（所）、疗养院以及企业事业单位、社会团体及其他社会组织举办的非营利性医院。《基层医疗卫生机构会计制度》适用于中国境内由政府举办的独立核算的城市社区卫生服务中心（站）、乡镇卫生院以及企业事业单位、社会团体及其他组织举办的非营利性医疗卫生机构。《医院会计制度》于2011年7月1日起在公立医院改革国家试点城市实施，自2012年1月1日起全国施行；《基层医疗卫生机构会计制度》于2011年7月1日起施行。根据会计制度要求，畅捷通开发财务管理系统医疗专版，满足各类医院和基层医疗机构财务核算和管理需要。
基层医疗财务管理及汇总报表系统主要包括总账管理、出纳管理、固定资产管理、工资管理、财务报表、报表设计、财务公式定义、财务取数、报表填写、数据审核、数据汇总和查询分析等功能模块，既能实现基层医疗卫生机构完成会计核算业务处理，又能满足医疗行业一般月报、年报的汇总和查询分析需要，支持上级的垂直监管。
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